Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
B4E1Z4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
B4E1Z4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
B4E1Z4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
B4E1Z4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
B4E1Z4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
B4E1Z4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
B4E1Z4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
B4E1Z4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
B4E1Z4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
B4E1Z4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
B4E1Z4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
B4E1Z4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
B4E1Z4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
B4E1Z4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
B4E1Z4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
B4E1Z4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
B4E1Z4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
B4E1Z4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
B4E1Z4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
B4E1Z4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
B4E1Z4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
B4E1Z4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
B4E1Z4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
B4E1Z4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
B4E1Z4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
B4E1Z4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
B4E1Z4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
B4E1Z4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
B4E1Z4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
B4E1Z4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
B4E1Z4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
B4E1Z4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
B4E1Z4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
B4E1Z4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
B4E1Z4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
B4E1Z4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
B4E1Z4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
B4E1Z4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
B4E1Z4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
B4E1Z4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
B4E1Z4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
B4E1Z4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
B4E1Z4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
B4E1Z4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
B4E1Z4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
B4E1Z4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
B4E1Z4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
B4E1Z4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
B4E1Z4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
B4E1Z4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
B4E1Z4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
B4E1Z4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
B4E1Z4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
B4E1Z4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
B4E1Z4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
B4E1Z4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
B4E1Z4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
B4E1Z4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
B4E1Z4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
B4E1Z4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
B4E1Z4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
B4E1Z4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
B4E1Z4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
B4E1Z4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
B4E1Z4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
B4E1Z4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
B4E1Z4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
B4E1Z4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
B4E1Z4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
B4E1Z4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
B4E1Z4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
B4E1Z4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
B4E1Z4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
B4E1Z4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
B4E1Z4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
B4E1Z4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
B4E1Z4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
B4E1Z4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
B4E1Z4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
B4E1Z4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
B4E1Z4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
B4E1Z4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
B4E1Z4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
B4E1Z4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
B4E1Z4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
B4E1Z4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
B4E1Z4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
B4E1Z4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
B4E1Z4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
B4E1Z4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
B4E1Z4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
B4E1Z4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
B4E1Z4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
B4E1Z4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
B4E1Z4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
B4E1Z4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
B4E1Z4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
B4E1Z4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
B4E1Z4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.2 ms