Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRRM5B3KS81 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRRM5B3KS81 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRRM5B3KS81 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRRM5B3KS81 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRRM5B3KS81 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRRM5B3KS81 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRRM5B3KS81 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SRRM5B3KS81 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRRM5B3KS81 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRRM5B3KS81 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SRRM5B3KS81 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRRM5B3KS81 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms