Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTLL13PA6NNM8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTLL13PA6NNM8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTLL13PA6NNM8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTLL13PA6NNM8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTLL13PA6NNM8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTLL13PA6NNM8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTLL13PA6NNM8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTLL13PA6NNM8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTLL13PA6NNM8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTLL13PA6NNM8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTLL13PA6NNM8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTLL13PA6NNM8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTLL13PA6NNM8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTLL13PA6NNM8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTLL13PA6NNM8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTLL13PA6NNM8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTLL13PA6NNM8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTLL13PA6NNM8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTLL13PA6NNM8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTLL13PA6NNM8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTLL13PA6NNM8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTLL13PA6NNM8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTLL13PA6NNM8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTLL13PA6NNM8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTLL13PA6NNM8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTLL13PA6NNM8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTLL13PA6NNM8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTLL13PA6NNM8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTLL13PA6NNM8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTLL13PA6NNM8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTLL13PA6NNM8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TTLL13PA6NNM8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms