Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RGPD3A6NKT7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RGPD3A6NKT7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RGPD3A6NKT7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
RGPD3A6NKT7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RGPD3A6NKT7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RGPD3A6NKT7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RGPD3A6NKT7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
RGPD3A6NKT7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RGPD3A6NKT7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RGPD3A6NKT7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RGPD3A6NKT7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RGPD3A6NKT7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RGPD3A6NKT7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RGPD3A6NKT7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RGPD3A6NKT7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RGPD3A6NKT7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RGPD3A6NKT7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RGPD3A6NKT7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
RGPD3A6NKT7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RGPD3A6NKT7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RGPD3A6NKT7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RGPD3A6NKT7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RGPD3A6NKT7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
RGPD3A6NKT7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
RGPD3A6NKT7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RGPD3A6NKT7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RGPD3A6NKT7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
RGPD3A6NKT7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RGPD3A6NKT7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RGPD3A6NKT7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
RGPD3A6NKT7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
RGPD3A6NKT7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
RGPD3A6NKT7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RGPD3A6NKT7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RGPD3A6NKT7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RGPD3A6NKT7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RGPD3A6NKT7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RGPD3A6NKT7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RGPD3A6NKT7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RGPD3A6NKT7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RGPD3A6NKT7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RGPD3A6NKT7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RGPD3A6NKT7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RGPD3A6NKT7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RGPD3A6NKT7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
RGPD3A6NKT7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
RGPD3A6NKT7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RGPD3A6NKT7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
RGPD3A6NKT7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RGPD3A6NKT7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
RGPD3A6NKT7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RGPD3A6NKT7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RGPD3A6NKT7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RGPD3A6NKT7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RGPD3A6NKT7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RGPD3A6NKT7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RGPD3A6NKT7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RGPD3A6NKT7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RGPD3A6NKT7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RGPD3A6NKT7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RGPD3A6NKT7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RGPD3A6NKT7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RGPD3A6NKT7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RGPD3A6NKT7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RGPD3A6NKT7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RGPD3A6NKT7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RGPD3A6NKT7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RGPD3A6NKT7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
RGPD3A6NKT7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RGPD3A6NKT7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RGPD3A6NKT7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RGPD3A6NKT7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RGPD3A6NKT7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
RGPD3A6NKT7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RGPD3A6NKT7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RGPD3A6NKT7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RGPD3A6NKT7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RGPD3A6NKT7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RGPD3A6NKT7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RGPD3A6NKT7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
RGPD3A6NKT7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RGPD3A6NKT7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RGPD3A6NKT7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RGPD3A6NKT7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RGPD3A6NKT7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RGPD3A6NKT7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
RGPD3A6NKT7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RGPD3A6NKT7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RGPD3A6NKT7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RGPD3A6NKT7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RGPD3A6NKT7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RGPD3A6NKT7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RGPD3A6NKT7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RGPD3A6NKT7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RGPD3A6NKT7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RGPD3A6NKT7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RGPD3A6NKT7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RGPD3A6NKT7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RGPD3A6NKT7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms