Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TVP23AA6NH52 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TVP23AA6NH52 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms