Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
ZNF316A6NFI3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC33.81■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC33.8■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.77■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
ZNF316A6NFI3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ZNF316A6NFI3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
ZNF316A6NFI3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ZNF316A6NFI3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ZNF316A6NFI3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ZNF316A6NFI3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ZNF316A6NFI3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ZNF316A6NFI3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ZNF316A6NFI3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ZNF316A6NFI3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ZNF316A6NFI3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ZNF316A6NFI3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ZNF316A6NFI3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ZNF316A6NFI3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ZNF316A6NFI3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ZNF316A6NFI3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ZNF316A6NFI3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ZNF316A6NFI3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ZNF316A6NFI3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ZNF316A6NFI3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ZNF316A6NFI3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms