Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA6BA6NDN3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA6BA6NDN3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms