Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNDIG1LA6NDD5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNDIG1LA6NDD5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNDIG1LA6NDD5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms