Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LCHNA4D1U4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LCHNA4D1U4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LCHNA4D1U4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LCHNA4D1U4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LCHNA4D1U4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LCHNA4D1U4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LCHNA4D1U4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LCHNA4D1U4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LCHNA4D1U4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LCHNA4D1U4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LCHNA4D1U4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LCHNA4D1U4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LCHNA4D1U4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LCHNA4D1U4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LCHNA4D1U4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LCHNA4D1U4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LCHNA4D1U4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LCHNA4D1U4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LCHNA4D1U4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LCHNA4D1U4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LCHNA4D1U4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LCHNA4D1U4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LCHNA4D1U4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LCHNA4D1U4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LCHNA4D1U4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LCHNA4D1U4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LCHNA4D1U4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LCHNA4D1U4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LCHNA4D1U4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LCHNA4D1U4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LCHNA4D1U4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCHNA4D1U4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCHNA4D1U4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LCHNA4D1U4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCHNA4D1U4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCHNA4D1U4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LCHNA4D1U4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LCHNA4D1U4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LCHNA4D1U4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LCHNA4D1U4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LCHNA4D1U4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LCHNA4D1U4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LCHNA4D1U4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LCHNA4D1U4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LCHNA4D1U4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LCHNA4D1U4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LCHNA4D1U4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LCHNA4D1U4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LCHNA4D1U4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LCHNA4D1U4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LCHNA4D1U4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LCHNA4D1U4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LCHNA4D1U4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LCHNA4D1U4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LCHNA4D1U4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LCHNA4D1U4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms