Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMCO3A2RU48 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms