Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMD3A2A2Y4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FRMD3A2A2Y4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms