Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNSTRNQ9Y448 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms