Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AC022384.1-202ENST00000450534 2831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms