Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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