Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms