Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms