Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMPRSS11EQ9UL52 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms