Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBE1Q9UJT0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBE1Q9UJT0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBE1Q9UJT0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBE1Q9UJT0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBE1Q9UJT0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBE1Q9UJT0 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBE1Q9UJT0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBE1Q9UJT0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms