Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms