Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms