Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPARGC1AQ9UBK2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms