Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms