Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCMF1Q9P0J7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms