Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA13Q9P0J0 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms