Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms