Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG7

SIRT3, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-3, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT3Q9NTG7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIRT3Q9NTG7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms