Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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LHX9Q9NQ69 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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