Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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