Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms