Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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