Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
COMMD5Q9GZQ3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms