Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDGFDQ9GZP0 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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