Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCSER1Q9C0I3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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