Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms