Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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