Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms