Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms