Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF17Q9BXT8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms