Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SALL3Q9BXA9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms