Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms