Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS1Q99742 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS1Q99742 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPAS1Q99742 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NPAS1Q99742 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NPAS1Q99742 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPAS1Q99742 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPAS1Q99742 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPAS1Q99742 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPAS1Q99742 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NPAS1Q99742 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPAS1Q99742 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPAS1Q99742 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
NPAS1Q99742 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NPAS1Q99742 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NPAS1Q99742 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NPAS1Q99742 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NPAS1Q99742 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPAS1Q99742 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPAS1Q99742 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPAS1Q99742 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPAS1Q99742 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NPAS1Q99742 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NPAS1Q99742 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NPAS1Q99742 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NPAS1Q99742 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NPAS1Q99742 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPAS1Q99742 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NPAS1Q99742 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPAS1Q99742 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPAS1Q99742 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPAS1Q99742 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPAS1Q99742 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPAS1Q99742 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms