Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms