Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms