Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms