Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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UBE2E2Q96LR5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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UBE2E2Q96LR5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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UBE2E2Q96LR5 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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UBE2E2Q96LR5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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UBE2E2Q96LR5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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UBE2E2Q96LR5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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UBE2E2Q96LR5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UBE2E2Q96LR5 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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