Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms