Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms