Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms