Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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ZNF439Q8NDP4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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ZNF439Q8NDP4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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ZNF439Q8NDP4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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ZNF439Q8NDP4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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ZNF439Q8NDP4 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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ZNF439Q8NDP4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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ZNF439Q8NDP4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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