Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CARMIL3Q8ND23 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms